1893年，圣母昆仲会应邀在耶稣会神父创办的上海圣方济书院任教。1896年，修士获任命全权负责学校工作。1950年书院改组，修士转而来到香港，在圣马丁英文书院进行宗教教育。

1952年，圣母昆仲会修士接手书院工作。1954年，接获教育署资助，在枫叶街与梧桐街交界处兴建了新校舍。这就是我们的兄弟学校——九龙圣方济书院。

愿景

培育学生成为能力卓越，具社会承担的正直公民，心怀天主教价值观，贡献社会。

使命

为学生提供学习福音教义的机会，以丰富他们的属灵生活。

以全人教育为培育理念，充分发展学生在德、智、体、群、美的潜能。

向学生灌输正确的道德价值观，使他们有积极的人生目标，关心他人。

通过各种课外活动为学生提供多采多姿的校园生活，以发展他们的人际关係和领导能力。

帮助学生建立个人自信，以使他们能够正面积极地迎接将来的挑战和变化。

校园

自校舍新翼于2004年7月落成后，本校共有25个标准课室、4个实验室、STEM活动室、电脑室、图书馆、地理室、视觉艺术室、音乐室、学生活动中心、小圣堂。至于新落成的礼堂，实用面积为1518平方米、内有最新音响及灯光设备。