在中一至中三阶段，学校根据香港课程的要求，通过IB中学课程的教学框架，为学生提供广阔而均衡的学习体验。

在中四至中六阶段，学生主要修读香港中学文凭课程，而部分合适的同学，可以于中五及中六选读IB文凭预科项目。

启思中学的两个文凭课程，均能提供广泛的选修科目给学生选择，令他们可以追寻个别的志趣。

在整个中一至中六期间，学生均有机会参与学校的「个人成长计划」，同时亦可参加各式各样的「体验式学习」，让学生在正规课程以外的学习更为丰盛。